Nakon što je Paulijus Motiejunjas izabran za novog direktora Evrolige, mora je da podnese ostavku na mjesto generalnog menadžera Žalgirisa.

Tim iz Kaunasa je odmah reagovao i na njegovo mjesto imenovao legendu kluba, bivšeg kapitena Paulijusa Jankunasa. 

"Raspoloženje je dobro, jako sam srećan, ali takođe shvatam da je odgovornost velika. Tokom prošle godine u Žalgirisovoj upravi puno sam naučio od Motiejunasa, on je bio osoba koja mi je pokazala kako sve funkcioniše. Kao što je rekao, ne ostavlja me ovdje samog. To je cijela organizacija Žalgirisa sa svim odjeljenjima, a to su ljudi koji razumiju svoj posao, radili su ga do sada i doveli Žalgiris na nivo na kojoj je danas. Nastaviću da surađujem sa njima. Samo sada dobijam puno više aktivnosti i jako sam srećan zbog toga", istakao je Jankunas. 

Jankunas je praktično čitavu karijeru proveo u Žalgirisu.

Stigao je 2003, a u penziju je otišao ljeta prošle godine.

Samo je sezonu 2009/2010. proveo u ruskom Himkiju.