Çrregullohet rrjedha natyrore e Cemit, i kërcënohet edhe ndotja Kanioni i Cemit është e mirë natyrore e mbrojtur nga viti 2017. Delegacioni i Bashkimit Europian i dha përkrahje kësaj iniciative përmes projektit "Aksioni i përbashkët ekologjik për ruajtjen e lumit Cem dhe zhvillimi i qëndrueshëm i rajonit ndërkufitar".