Cilj Sporazuma je unapređenje dobrih odnosa i poslovnih procesa u području koji je od zajedničkog interesa, a odnosi se na EU pretpristupni i pristupni proces, odnosno pripremu cjelokupnog sistema za sprovođenje, za što bolje korišćenje EU sredstava.

Direktorat za plaćanja i Uprava za agrarna plaćanja su u potpunosti odlučni da unaprijede zajedničku saradnju, odnosno pojačaju razmjenu znanja i iskustava u oblasti pripreme za korišćenje i korišćenja pretpristupnih EU fondova za ruralni razvoj s ciljem postizanja što uspješnije integracije u Evropsku uniju.

Sporazumom je, kako navode iz Ministarstva poljoprivrede, šumarstva i vodoprivrede, definisano da će obje institucije uzajamno sarađivati, razmjenjivati podatke, iskustva, znanja i stručnjake u području IPARD-a unutar obavezujućeg EU pravnog okvira, kao i relevantnog pravnog okvira svake od država.

Dogovorena je saradnja i pružanje uzajamne pomoći na razvijanju struktura, kao i unapređenju aktivnosti s područja poljoprivrede i ruralnog razvoja (direktnih plaćanja, prava na plaćanja, identifikacije zemljišnih parcela, ruralnih mjera, cjelokupnog IAKS-a, zajedničke organizacije tržišta) s ciljem što bolje pripremljenosti sistema, institucionalne strukture, kao i znanja i vještina zaposlenih za korišćenje sredstava EAFRD fonda i sprovođenje ruralne politike Evropske unije.